| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 04.05.2003, Вс | 1 тур | Луч-Энергия Владивосток | 2:3 П | |||
| 07.05.2003, Ср | 2 тур | Океан Находка | 0:0 Н | |||
| 15.05.2003, Чт | 3 тур | Металлург Красноярск | 1:2 П | |||
| 18.05.2003, Вс | 4 тур | Сибиряк Братск | 0:0 Н | |||
| 30.05.2003, Пт | 6 тур | Шахтер Прокопьевск | 2:0 В | |||
| 07.06.2003, Сб | 7 тур | Чкаловец-Олимпик Новосибирск | 0:0 Н | |||
| 10.06.2003, Вт | 8 тур | Динамо Барнаул | 1:0 В | |||
| 19.06.2003, Чт | 9 тур | Селенга Улан-Удэ | 2:0 В | |||
| 22.06.2003, Вс | 10 тур | Звезда Иркутск | 2:2 Н | |||
| 03.07.2003, Чт | 12 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:1 Н | |||
| 11.07.2003, Пт | 13 тур | Иртыш Омск | 1:1 Н | |||
| 14.07.2003, Пн | 14 тур | Чкаловец-1936 Новосибирск | 3:2 В | |||
| 05.08.2003, Вт | 15 тур | Металлург Красноярск | 3:1 В | |||
| 08.08.2003, Пт | 16 тур | Сибиряк Братск | 1:3 П | |||
| 19.08.2003, Вт | 18 тур | Шахтер Прокопьевск | 2:0 В | |||
| 28.08.2003, Чт | 19 тур | Чкаловец-Олимпик Новосибирск | 2:0 В | |||
| 31.08.2003, Вс | 20 тур | Динамо Барнаул | 0:1 П | |||
| 07.09.2003, Вс | 21 тур | Селенга Улан-Удэ | 0:0 Н | |||
| 10.09.2003, Ср | 22 тур | Звезда Иркутск | 0:0 Н | |||
| 17.09.2003, Ср | 23 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 2:2 Н | |||
| 27.09.2003, Сб | 25 тур | Иртыш Омск | 0:1 П | |||
| 30.09.2003, Вт | 26 тур | Чкаловец-1936 Новосибирск | 2:2 Н | |||
| 07.10.2003, Вт | 27 тур | Луч-Энергия Владивосток | 0:0 Н | |||
| 10.10.2003, Пт | 28 тур | Океан Находка | 0:1 П | |||
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+4)